现阶段烟草科技工作的基本思路是：以党的十六大精神为指导，实施“科教兴烟”战略，以降焦减害为主线，以发展中式卷烟为方向，继续加大科技教育投入，深化科技管理和体制改革，扬长避短，突出重点，联合攻关，集成推广，强化技术监督和标准化工作，努力提高行业科学技术水平和专业技术队伍素质水平，为实现面对两个“W”挑战转折时期的中国烟草持续、稳定、健康发展提供技术保障和智力支持。

近期烟草科技工作的主要目标是：以降焦减害为主线，以发展中式卷烟和生产满足烟草工业需要的优质烟叶为重点，全面提升中国烟草科技水平，着重抓好以下六项工作：第一，把降焦减害和发展中式卷烟作为中心任务，促进卷烟产品质量和竞争能力的整体提升；第二，坚持市场为导向，加大优质烟叶生产技术的研究和推广力度，努力满足卷烟生产需求；第三，整合资源，优化配置，大力推进烟草行业科技创新体系建设；第四，加强关键技术研究和技术集成，加速科技成果转化；第五，要进一步加强行业技术监督工作，健全行业标准体系，提高质量监督的有效性；第六，加大科技投入，加速培养一支高素质的烟草科技队伍。